以下三种设置方法均需要PHP版本为5.3或者以上。
方法1）在Nginx配置文件中加入
fastcgi_param PHP_VALUE "open_basedir=$document_root:/tmp/:/proc/";
通常nginx的站点配置文件里用了include fastcgi.conf;，这样的，把这行加在fastcgi.conf里就OK了。
如果某个站点需要单独设置额外的目录，把上面的代码写在include fastcgi.conf;这行下面就OK了，会把fastcgi.conf中的设置覆盖掉。
这种方式的设置需要重启nginx后生效。
方法2）在php.ini中加入：
[HOST=www.at
cpu.com]
open_basedir=/home/www/www.atcpu.com:/tmp/:/proc/
[PATH=/home/www/www.atcpu.com]
open_basedir=/home/www/www.atcpu.com:/tmp/:/proc/
这种方式的设置需要重启php-fpm后生效。
方法3）在网站根目录下创建.user.ini并写入：
open_basedir=/home/www/www.atcpu.com:/tmp/:/proc/
这种方式不需要重启nginx或php-fpm服务。安全起见应当取消掉.user.ini文件的写权限。
关于.user.ini文件的详细说明：
http://php.net/manual/zh/configuration.file.per-user.php
设置open_basedir的同时最好禁止下执行命令的函数，比如：
shell_exec('ls /etc')仍然查看到/etc目录的文件列表
shell_exec('cat /etc/passwd')仍可查看到/etc/passwd文件的内容
建议禁止的函数如下：
disable_functions = pcntl_alarm, pcntl_fork, pcntl_waitpid, pcntl_wait, pcntl_wifexited, pcntl_wifstopped, pcntl_wifsignaled, pcntl_wexitstatus, pcntl_wtermsig, pcntl_wstopsig, pcntl_signal, pcntl_signal_dispatch, pcntl_get_last_error, pcntl_strerror, pcntl_sigprocmask, pcntl_sigwaitinfo, pcntl_sigtimedwait, pcntl_exec, pcntl_getpriority, pcntl_setpriority, eval, popen, passthru, exec, system, shell_exec, proc_open, proc_get_status, chroot, chgrp, chown, ini_alter, ini_restore, dl, pfsockopen, openlog, syslog, readlink, symlink, popepassthru, stream_socket_server, fsocket, chdir
